Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ETV1P50549 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ETV1P50549 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV1P50549 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms