Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MRE11P49959 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRE11P49959 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRE11P49959 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRE11P49959 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRE11P49959 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRE11P49959 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRE11P49959 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRE11P49959 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRE11P49959 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRE11P49959 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRE11P49959 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRE11P49959 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MRE11P49959 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRE11P49959 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRE11P49959 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRE11P49959 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRE11P49959 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRE11P49959 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRE11P49959 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRE11P49959 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRE11P49959 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MRE11P49959 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRE11P49959 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRE11P49959 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRE11P49959 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRE11P49959 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRE11P49959 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRE11P49959 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRE11P49959 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms