Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP153P49790 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP153P49790 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP153P49790 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP153P49790 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP153P49790 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NUP153P49790 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NUP153P49790 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NUP153P49790 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NUP153P49790 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NUP153P49790 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NUP153P49790 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NUP153P49790 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NUP153P49790 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP153P49790 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms