Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTPAP49638 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TTPAP49638 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TTPAP49638 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TTPAP49638 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
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