Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGM4P49221 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms