Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A3P48751 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms