Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTDSS1P48651 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms