Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RANGAP1P46060 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RANGAP1P46060 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms