Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP5P45974 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP5P45974 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP5P45974 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP5P45974 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP5P45974 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP5P45974 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP5P45974 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP5P45974 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
USP5P45974 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP5P45974 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP5P45974 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms