Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAD52P43351 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD52P43351 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD52P43351 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD52P43351 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD52P43351 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD52P43351 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD52P43351 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD52P43351 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD52P43351 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAD52P43351 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAD52P43351 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms