Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CRATP43155 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CRATP43155 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CRATP43155 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRATP43155 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRATP43155 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRATP43155 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRATP43155 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRATP43155 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRATP43155 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CRATP43155 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms