Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTGDSP41222 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms