Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDH1P40925 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDH1P40925 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDH1P40925 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MDH1P40925 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MDH1P40925 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MDH1P40925 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDH1P40925 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms