Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LTBRP36941 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBRP36941 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBRP36941 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBRP36941 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBRP36941 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBRP36941 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBRP36941 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBRP36941 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LTBRP36941 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LTBRP36941 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LTBRP36941 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LTBRP36941 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms