Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GABRA5P31644 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GABRA5P31644 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms