Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC12P31275 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms