Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGB2P26583 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms