Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2AP24928 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms