Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP5F1P24539 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms