Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NF1P21359 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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NF1P21359 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NF1P21359 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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NF1P21359 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NF1P21359 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NF1P21359 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NF1P21359 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NF1P21359 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NF1P21359 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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NF1P21359 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NF1P21359 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NF1P21359 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NF1P21359 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NF1P21359 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NF1P21359 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NF1P21359 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NF1P21359 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
NF1P21359 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NF1P21359 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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