Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATF1P18846 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms