Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCL3L1P16619 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms