Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GNB3P16520 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GNB3P16520 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms