Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTLA4P16410 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms