Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL6A2P12110 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms