Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ESRRAP11474 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms