Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VSIG8P0DPA2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms