Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
U2AF1L5P0DN76 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
U2AF1L5P0DN76 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms