Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMIGD3P0DMS9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms