Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEFMP07197 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFMP07197 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFMP07197 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFMP07197 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFMP07197 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFMP07197 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEFMP07197 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEFMP07197 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEFMP07197 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEFMP07197 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms