Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEFLP07196 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEFLP07196 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEFLP07196 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms