Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPTA1P02549 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPTA1P02549 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms