Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINC1P01008 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINC1P01008 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms