Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SVILO95425 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SVILO95425 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SVILO95425 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SVILO95425 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms