Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAPGEF3O95398 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAPGEF3O95398 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAPGEF3O95398 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAPGEF3O95398 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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