Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SCN2BO60939 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms