Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY75O60449 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY75O60449 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY75O60449 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY75O60449 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY75O60449 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY75O60449 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY75O60449 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY75O60449 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LY75O60449 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LY75O60449 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LY75O60449 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
LY75O60449 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LY75O60449 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY75O60449 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY75O60449 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY75O60449 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms