Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK2O60296 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK2O60296 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK2O60296 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK2O60296 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK2O60296 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK2O60296 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK2O60296 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK2O60296 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK2O60296 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK2O60296 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK2O60296 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAK2O60296 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAK2O60296 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms