Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTATSF1O43719 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms