Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCAO15360 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCAO15360 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCAO15360 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCAO15360 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FANCAO15360 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FANCAO15360 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FANCAO15360 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FANCAO15360 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms