Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYNJ2O15056 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYNJ2O15056 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms