Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNAP23O00161 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNAP23O00161 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms