Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SRRM4A7MD48 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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