Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
STRCP1A6NGW2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STRCP1A6NGW2 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms