Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC144AA2RUR9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC144AA2RUR9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms