Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX8Q9Y5X2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX8Q9Y5X2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX8Q9Y5X2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX8Q9Y5X2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms