Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRELID3BQ9Y3B1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PRELID3BQ9Y3B1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms