Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt17Q9QWL7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt17Q9QWL7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt17Q9QWL7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt17Q9QWL7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt17Q9QWL7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt17Q9QWL7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms