Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Actn2Q9JI91 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Actn2Q9JI91 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Actn2Q9JI91 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms