Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RPF2Q9H7B2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPF2Q9H7B2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPF2Q9H7B2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPF2Q9H7B2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms